Midler til driften av Petoro AS bevilges årlig av staten som er direkte ansvarlig for de forpliktelser selskapet pådrar seg. Årsregnskapet er satt opp i samsvar med regnskapslovens bestemmelser og norske regnskapsstandarder for øvrige foretak. Selskapet fører særskilt regnskap for alle transaksjoner knyttet til deltakerandelene, slik at inntekter og kostnader fra porteføljen holdes adskilt fra driften av Petoro.